第三十二條 國(guó)務(wù)院有關(guān)部門和長(zhǎng)江流域地方各級(jí)人民政府應(yīng)當(dāng)采取措施，加快病險(xiǎn)水庫(kù)除險(xiǎn)加固，推進(jìn)堤防和蓄滯洪區(qū)建設(shè)，提升洪澇災(zāi)害防御工程標(biāo)準(zhǔn)，加強(qiáng)水工程聯(lián)合調(diào)度，開展河道泥沙觀測(cè)和河勢(shì)調(diào)查，建立與經(jīng)濟(jì)社會(huì)發(fā)展相適應(yīng)的防洪減災(zāi)工程和非工程體系，提高防御水旱災(zāi)害的整體能力。
第三十三條 國(guó)家對(duì)跨長(zhǎng)江流域調(diào)水實(shí)行科學(xué)論證，加強(qiáng)控制和管理。實(shí)施跨長(zhǎng)江流域調(diào)水應(yīng)當(dāng)優(yōu)先保障調(diào)出區(qū)域及其下游區(qū)域的用水安全和生態(tài)安全，統(tǒng)籌調(diào)出區(qū)域和調(diào)入?yún)^(qū)域用水需求。
第三十四條 國(guó)家加強(qiáng)長(zhǎng)江流域飲用水水源地保護(hù)。國(guó)務(wù)院水行政主管部門會(huì)同國(guó)務(wù)院有關(guān)部門制定長(zhǎng)江流域飲用水水源地名錄。長(zhǎng)江流域省級(jí)人民政府水行政主管部門會(huì)同本級(jí)人民政府有關(guān)部門制定本行政區(qū)域的其他飲用水水源地名錄。
長(zhǎng)江流域省級(jí)人民政府組織劃定飲用水水源保護(hù)區(qū)，加強(qiáng)飲用水水源保護(hù)，保障飲用水安全。
第三十五條 長(zhǎng)江流域縣級(jí)以上地方人民政府及其有關(guān)部門應(yīng)當(dāng)合理布局飲用水水源取水口，制定飲用水安全突發(fā)事件應(yīng)急預(yù)案，加強(qiáng)飲用水備用應(yīng)急水源建設(shè)，對(duì)飲用水水源的水環(huán)境質(zhì)量進(jìn)行實(shí)時(shí)監(jiān)測(cè)。
第三十六條 丹江口庫(kù)區(qū)及其上游所在地縣級(jí)以上地方人民政府應(yīng)當(dāng)按照飲用水水源地安全保障區(qū)、水質(zhì)影響控制區(qū)、水源涵養(yǎng)生態(tài)建設(shè)區(qū)管理要求，加強(qiáng)山水林田湖草整體保護(hù)，增強(qiáng)水源涵養(yǎng)能力，保障水質(zhì)穩(wěn)定達(dá)標(biāo)。
第三十七條 國(guó)家加強(qiáng)長(zhǎng)江流域地下水資源保護(hù)。長(zhǎng)江流域縣級(jí)以上地方人民政府及其有關(guān)部門應(yīng)當(dāng)定期調(diào)查評(píng)估地下水資源狀況，監(jiān)測(cè)地下水水量、水位、水環(huán)境質(zhì)量，并采取相應(yīng)風(fēng)險(xiǎn)防范措施，保障地下水資源安全。
第三十八條 國(guó)務(wù)院水行政主管部門會(huì)同國(guó)務(wù)院有關(guān)部門確定長(zhǎng)江流域農(nóng)業(yè)、工業(yè)用水效率目標(biāo)，加強(qiáng)用水計(jì)量和監(jiān)測(cè)設(shè)施建設(shè)；完善規(guī)劃和建設(shè)項(xiàng)目水資源論證制度；加強(qiáng)對(duì)高耗水行業(yè)、重點(diǎn)用水單位的用水定額管理，嚴(yán)格控制高耗水項(xiàng)目建設(shè)。
第三十九條 國(guó)家統(tǒng)籌長(zhǎng)江流域自然保護(hù)地體系建設(shè)。國(guó)務(wù)院和長(zhǎng)江流域省級(jí)人民政府在長(zhǎng)江流域重要典型生態(tài)系統(tǒng)的完整分布區(qū)、生態(tài)環(huán)境敏感區(qū)以及珍貴野生動(dòng)植物天然集中分布區(qū)和重要棲息地、重要自然遺跡分布區(qū)等區(qū)域，依法設(shè)立國(guó)家公園、自然保護(hù)區(qū)、自然公園等自然保護(hù)地。
第四十條 國(guó)務(wù)院和長(zhǎng)江流域省級(jí)人民政府應(yīng)當(dāng)依法在長(zhǎng)江流域重要生態(tài)區(qū)、生態(tài)狀況脆弱區(qū)劃定公益林，實(shí)施嚴(yán)格管理。國(guó)家對(duì)長(zhǎng)江流域天然林實(shí)施嚴(yán)格保護(hù)，科學(xué)劃定天然林保護(hù)重點(diǎn)區(qū)域。
長(zhǎng)江流域縣級(jí)以上地方人民政府應(yīng)當(dāng)加強(qiáng)對(duì)長(zhǎng)江流域草原資源的保護(hù)，對(duì)具有調(diào)節(jié)氣候、涵養(yǎng)水源、保持水土、防風(fēng)固沙等特殊作用的基本草原實(shí)施嚴(yán)格管理。
國(guó)務(wù)院林業(yè)和草原主管部門和長(zhǎng)江流域省級(jí)人民政府林業(yè)和草原主管部門會(huì)同本級(jí)人民政府有關(guān)部門，根據(jù)不同生態(tài)區(qū)位、生態(tài)系統(tǒng)功能和生物多樣性保護(hù)的需要，發(fā)布長(zhǎng)江流域國(guó)家重要濕地、地方重要濕地名錄及保護(hù)范圍，加強(qiáng)對(duì)長(zhǎng)江流域濕地的保護(hù)和管理，維護(hù)濕地生態(tài)功能和生物多樣性。
第四十一條 國(guó)務(wù)院農(nóng)業(yè)農(nóng)村主管部門會(huì)同國(guó)務(wù)院有關(guān)部門和長(zhǎng)江流域省級(jí)人民政府建立長(zhǎng)江流域水生生物完整性指數(shù)評(píng)價(jià)體系，組織開展長(zhǎng)江流域水生生物完整性評(píng)價(jià)，并將結(jié)果作為評(píng)估長(zhǎng)江流域生態(tài)系統(tǒng)總體狀況的重要依據(jù)。長(zhǎng)江流域水生生物完整性指數(shù)應(yīng)當(dāng)與長(zhǎng)江流域水環(huán)境質(zhì)量標(biāo)準(zhǔn)相銜接。
第四十二條 國(guó)務(wù)院農(nóng)業(yè)農(nóng)村主管部門和長(zhǎng)江流域縣級(jí)以上地方人民政府應(yīng)當(dāng)制定長(zhǎng)江流域珍貴、瀕危水生野生動(dòng)植物保護(hù)計(jì)劃，對(duì)長(zhǎng)江流域珍貴、瀕危水生野生動(dòng)植物實(shí)行重點(diǎn)保護(hù)。
國(guó)家鼓勵(lì)有條件的單位開展對(duì)長(zhǎng)江流域江豚、白鱀豚、白鱘、中華鱘、長(zhǎng)江鱘、鯮、鰣、四川白甲魚、川陜哲羅鮭、胭脂魚、鳤、圓口銅魚、多鱗白甲魚、華鯪、鱸鯉和葛仙米、弧形藻、眼子菜、水菜花等水生野生動(dòng)植物生境特征和種群動(dòng)態(tài)的研究，建設(shè)人工繁育和科普教育基地，組織開展水生生物救護(hù)。
禁止在長(zhǎng)江流域開放水域養(yǎng)殖、投放外來(lái)物種或者其他非本地物種種質(zhì)資源。
第四十三條 國(guó)務(wù)院生態(tài)環(huán)境主管部門和長(zhǎng)江流域地方各級(jí)人民政府應(yīng)當(dāng)采取有效措施，加大對(duì)長(zhǎng)江流域的水污染防治、監(jiān)管力度，預(yù)防、控制和減少水環(huán)境污染。
第四十四條 國(guó)務(wù)院生態(tài)環(huán)境主管部門負(fù)責(zé)制定長(zhǎng)江流域水環(huán)境質(zhì)量標(biāo)準(zhǔn)，對(duì)國(guó)家水環(huán)境質(zhì)量標(biāo)準(zhǔn)中未作規(guī)定的項(xiàng)目可以補(bǔ)充規(guī)定；對(duì)國(guó)家水環(huán)境質(zhì)量標(biāo)準(zhǔn)中已經(jīng)規(guī)定的項(xiàng)目，可以作出更加嚴(yán)格的規(guī)定。制定長(zhǎng)江流域水環(huán)境質(zhì)量標(biāo)準(zhǔn)應(yīng)當(dāng)征求國(guó)務(wù)院有關(guān)部門和有關(guān)省級(jí)人民政府的意見(jiàn)。長(zhǎng)江流域省級(jí)人民政府可以制定嚴(yán)于長(zhǎng)江流域水環(huán)境質(zhì)量標(biāo)準(zhǔn)的地方水環(huán)境質(zhì)量標(biāo)準(zhǔn)，報(bào)國(guó)務(wù)院生態(tài)環(huán)境主管部門備案。
