第四十五條　長江流域省級人民政府應當對沒有國家水污染物排放標準的特色產業、特有污染物，或者國家有明確要求的特定水污染源或者水污染物，補充制定地方水污染物排放標準，報國務院生態環境主管部門備案。

有下列情形之一的，長江流域省級人民政府應當制定嚴于國家水污染物排放標準的地方水污染物排放標準，報國務院生態環境主管部門備案：

（一）產業密集、水環境問題突出的；

（二）現有水污染物排放標準不能滿足所轄長江流域水環境質量要求的；

（三）流域或者區域水環境形勢復雜，無法適用統一的水污染物排放標準的。

第四十六條　長江流域省級人民政府制定本行政區域的總磷污染控制方案，并組織實施。對磷礦、磷肥生產集中的長江干支流，有關省級人民政府應當制定更加嚴格的總磷排放管控要求，有效控制總磷排放總量。

磷礦開采加工、磷肥和含磷農藥制造等企業，應當按照排污許可要求，采取有效措施控制總磷排放濃度和排放總量；對排污口和周邊環境進行總磷監測，依法公開監測信息。

第四十七條　長江流域縣級以上地方人民政府應當統籌長江流域城鄉污水集中處理設施及配套管網建設，并保障其正常運行，提高城鄉污水收集處理能力。

長江流域縣級以上地方人民政府應當組織對本行政區域的江河、湖泊排污口開展排查整治，明確責任主體，實施分類管理。

在長江流域江河、湖泊新設、改設或者擴大排污口，應當按照國家有關規定報經有管轄權的生態環境主管部門或者長江流域生態環境監督管理機構同意。對未達到水質目標的水功能區，除污水集中處理設施排污口外，應當嚴格控制新設、改設或者擴大排污口。

第四十八條　國家加強長江流域農業面源污染防治。長江流域農業生產應當科學使用農業投入品，減少化肥、農藥施用，推廣有機肥使用，科學處置農用薄膜、農作物秸稈等農業廢棄物。

第四十九條　禁止在長江流域河湖管理范圍內傾倒、填埋、堆放、棄置、處理固體廢物。長江流域縣級以上地方人民政府應當加強對固體廢物非法轉移和傾倒的聯防聯控。

第五十條　長江流域縣級以上地方人民政府應當組織對沿河湖垃圾填埋場、加油站、礦山、尾礦庫、危險廢物處置場、化工園區和化工項目等地下水重點污染源及周邊地下水環境風險隱患開展調查評估，并采取相應風險防范和整治措施。

第五十一條　國家建立長江流域危險貨物運輸船舶污染責任保險與財務擔保相結合機制。具體辦法由國務院交通運輸主管部門會同國務院有關部門制定。

禁止在長江流域水上運輸劇毒化學品和國家規定禁止通過內河運輸的其他危險化學品。長江流域縣級以上地方人民政府交通運輸主管部門會同本級人民政府有關部門加強對長江流域危險化學品運輸的管控。

第五十二條　國家對長江流域生態系統實行自然恢復為主、自然恢復與人工修復相結合的系統治理。國務院自然資源主管部門會同國務院有關部門編制長江流域生態環境修復規劃，組織實施重大生態環境修復工程，統籌推進長江流域各項生態環境修復工作。

第五十三條　國家對長江流域重點水域實行嚴格捕撈管理。在長江流域水生生物保護區全面禁止生產性捕撈；在國家規定的期限內，長江干流和重要支流、大型通江湖泊、長江河口規定區域等重點水域全面禁止天然漁業資源的生產性捕撈。具體辦法由國務院農業農村主管部門會同國務院有關部門制定。

國務院農業農村主管部門會同國務院有關部門和長江流域省級人民政府加強長江流域禁捕執法工作，嚴厲查處電魚、毒魚、炸魚等破壞漁業資源和生態環境的捕撈行為。

長江流域縣級以上地方人民政府應當按照國家有關規定做好長江流域重點水域退捕漁民的補償、轉產和社會保障工作。

長江流域其他水域禁捕、限捕管理辦法由縣級以上地方人民政府制定。

第五十四條　國務院水行政主管部門會同國務院有關部門制定并組織實施長江干流和重要支流的河湖水系連通修復方案，長江流域省級人民政府制定并組織實施本行政區域的長江流域河湖水系連通修復方案，逐步改善長江流域河湖連通狀況，恢復河湖生態流量，維護河湖水系生態功能。

第五十五條　國家長江流域協調機制統籌協調國務院自然資源、水行政、生態環境、住房和城鄉建設、農業農村、交通運輸、林業和草原等部門和長江流域省級人民政府制定長江流域河湖岸線修復規范，確定岸線修復指標。