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測序技術(shù),蛋白質(zhì)測序方法

來源:整理 時間:2023-03-27 02:07:56 編輯:好學(xué)習(xí) 手機(jī)版

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1,蛋白質(zhì)測序方法

Sanger試劑用于鑒定蛋白質(zhì)和多肽的N-末端氨基酸殘基。Edman降解才是氨基酸序列的測定技術(shù)。但是它不能測超過40個殘基的序列。所以測大的蛋白質(zhì)的序列時,需要用化學(xué)試劑將蛋白質(zhì)降解為一些肽段。即需要水解。水解時一般用三氟乙酸進(jìn)行酸水解。酸水解就是加熱酸進(jìn)行水解,而堿水解就是加入堿進(jìn)行水解。蛋白質(zhì)一般用酸水解。而酯類則兩種水解方式都常用。知道了嗎?^_^

蛋白質(zhì)測序方法

2,目前用于測序的技術(shù)主要有哪些

目前常用的測序技術(shù)有一代Sanger測序,二代常規(guī)的illumina測序,擎科生物推出的快速二代測序技術(shù)Fast NGS。三代的Pacbio和Nanopore測序。一代測序技術(shù)應(yīng)用1. PCR產(chǎn)物測序?qū)δ康幕虻腜CR產(chǎn)物進(jìn)行測序,獲取目的基因序列;2. 重測序如克隆產(chǎn)物驗證、SNPs、突變、插入、缺失等;3. 分型分析菌分類學(xué)鑒定、HLA分型、病毒分型等;4.臨床應(yīng)用腫瘤突變基因的檢測和腫瘤個體化治療,致病基因位點明確并且數(shù)量有限的單基因遺傳病檢測;5.對新一代測序技術(shù)的結(jié)果進(jìn)行驗證。 常規(guī)二代測序技術(shù)應(yīng)用1.基因組de novo測序、轉(zhuǎn)錄組測序、重測序、擴(kuò)增子測序、宏基因組測序、染色質(zhì)免疫共沉淀測序、DNA甲基化測序等。2.在醫(yī)學(xué)上的應(yīng)用主要包括癌癥基因組、遺傳病基因組、腫瘤與代謝疾病等。 Fast NGS應(yīng)用:1.抗體可變區(qū)測序;2.TA克隆測序;3.菌種鑒定;4.質(zhì)粒、病毒、線粒體、葉綠體等小基因組測序;5.基因編輯上可用于sgRNA文庫測序、靶基因鑒定、個體基因型檢測、基因編輯效率檢測。比常規(guī)二代測序更快速,更優(yōu)惠,對樣本要求更低。 三代測序技術(shù)的應(yīng)用:1.基因組組裝;2.全長轉(zhuǎn)錄組測序;3.甲基化測序等。

目前用于測序的技術(shù)主要有哪些

3,下一代測序技術(shù)有幾種

按原理分三種:Roche 454 焦磷酸測序,Iiiumina 是邊合成邊測序,ABI SOLID是 連接測序
最近市面上出現(xiàn)了很多新一代測序儀產(chǎn)品,例如美國roche appliedscience公司的454基因組測序儀、美國illumina公司和英國solexatechnology公司合作開發(fā)的illumina測序儀、美國appliedbiosystems公司的solid測序儀、dover/harvard公司的polonator測序儀以及美國helicos公司的heliscope單分子測序儀.所有這些新型測序儀都使用了一種新的測序策略——循環(huán)芯片測序法(cyclic-arraysequencing),也可將其稱為“新一代測序技術(shù)或者第二代測序技術(shù)

下一代測序技術(shù)有幾種

4,什么是DNA測序技術(shù)

bac是細(xì)菌人工染色體意思,之所以有bac文庫的出現(xiàn),是因為基因組序列太長,測序,以及篩選基因等沒有辦法完成,所以將基因組片段隨機(jī)打斷成片段,連到載體上構(gòu)建成一系列的重組子,這樣當(dāng)你需要特定的序列,只需要篩選出自己要的那個bac重組子就行了。說的有點過于簡單,不知道你能明白否?末端測序也是采用的雙脫氧終止法的。雙脫氧終止法的原理是;堿基之間是通過倆個堿基的5磷酸基團(tuán)和3羥基連接的,雙脫氧終止法就是利用了這個3羥基,將3羥基脫氧變成氫鍵,那么這樣下一個堿基的5磷酸基團(tuán)就沒有辦法連到前一個堿基上了。所以如果在做測序pcr的時候加一部分正常的dntp(3號位為羥基),加一定量的ddntp(2,3號位都是氫鍵),那么在第一個堿基后如果接上去的是dntp,那么就可以接著連第三個堿基,如果連得是ddntp,那么就沒有辦法連下個堿基形成鏈終止,在測序pcr中,數(shù)以萬計的反應(yīng),那么就會出現(xiàn)2個堿基后終止的鏈,也有可能出現(xiàn)3個,4個,n個堿基后終止的鏈,這樣就形成了一系列從一個堿基到n個堿基的序列(其最后一個堿基都是三號位為氫鍵的,這個應(yīng)該理解吧)。那么如果我們在連上去的ddntp上連上個熒光基團(tuán)(四種ddntp連上不同的熒光基團(tuán)),那么將這一系列長度的鏈跑膠,會形成一系列的帶,通過每條帶最后一個堿基的熒光通過機(jī)器就能夠區(qū)分是什么堿基,將這些堿基拼接好后就是你要的序列了。
DNA測序技術(shù),即測定DNA序列的技術(shù)。在分子生物學(xué)研究中,DNA的序列分析是進(jìn)一步研究和改造目的基因的基礎(chǔ)。目前用于測序的技術(shù)主要有Sanger等(1977)發(fā)明的雙脫氧鏈末端終止法和 Maxam和 Gilbert(1977)發(fā)明的化學(xué)降解法。這二種方法在原理上差異很大,但都是根據(jù)核苷酸在某一固定的點開始,隨機(jī)在某一個特定的堿基處終止,產(chǎn)生 A,T,C,G四組不同長度的一系列核苷酸,然后在尿素變性的PAGE膠上電泳進(jìn)行檢測,從而獲得DNA序列。目前 Sanger測序法得到了廣泛的應(yīng)用。http://baike.baidu.com/link?url=S8neqboyOrwW895RyI0CjFWkb6Wt2g6Hjabexm7DcZS8SDM5BR0UQex9rxvJPDkqMVO-Dk9S-PMsU4supZ5xna

5,DNA測序方法有哪些

第1 代測序技術(shù)——熒光標(biāo)記的Sanger 法第一代就不說了。第2 代測序技術(shù)——循環(huán)陣列合成測序法述第2 代測序技術(shù)中, 序列都是在熒光或者化學(xué)發(fā)光物質(zhì)的協(xié)助下, 通過讀取DNA 聚合酶或DNA 連接酶將堿基連接到DNA 鏈上過程中釋放出的光學(xué)信號而間接確定的. 除了需要昂貴的光學(xué)監(jiān)測系統(tǒng), 還要記錄、存儲并分析大量的光學(xué)圖像.這都使儀器的復(fù)雜性和成本增加. 依賴生物化學(xué)反應(yīng)讀取堿基序列更增加了試劑、耗材的使用, 在目前測序成本中比例相當(dāng)大. 直接讀取序列信息, 不使用化學(xué)試劑, 對于進(jìn)一步降低測序成本是非??扇〉?在一個正在發(fā)生突破瓶頸巨變的領(lǐng)域內(nèi), 很難準(zhǔn)確預(yù)測未來將發(fā)生什么.第3 代測序技術(shù)——直接測序?qū)⒒蚪MDNA 隨機(jī)切割成大約100 kb 左右的片段,制成單鏈并與六寡聚核苷酸探針雜交. 然后驅(qū)動結(jié)合了探針的基因組文庫片段通過可尋址的納米孔陣列. 通過每個孔的離子電流均可獨立測量. 追蹤電流的變化確定探針雜交在每個基因組片段上的精確位置. 利用基因組片段上雜交探針的重疊區(qū)域?qū)⒒蚪M片段文庫排列起來, 建立一組完整的基因組探針圖. 利用計算機(jī)算法, 獲得完整的基因組序列.
這位是搞分子生物學(xué)的嗎? dna測序的方法有很多種. 目前最常見的是雙脫氧終止法了. 在測序用的緩沖液中含有四種dntp及聚合酶. 測序時分成四個反應(yīng), 每個反應(yīng)除上述成分外分別加入2,3-雙脫氧的a, c, g, t核苷三磷酸(稱為ddatp, ddctp, ddgtp, ddttp), 然后進(jìn)行聚合反應(yīng). 在第一個反應(yīng)物中, ddatp會隨機(jī)地代替datp參加反應(yīng)一旦ddatp加入了新合成的dna鏈, 由于其3位的羥基變成了氫, 所以不能繼續(xù)延伸. 所以第一個反應(yīng)中所產(chǎn)生的dna鏈都是到a就終止了; 同理第二個反應(yīng)產(chǎn)生的都是以c結(jié)尾的; 第三個反應(yīng)的都以g結(jié)尾, 第四個反應(yīng)的都以t結(jié)尾, 電泳后就可以讀出序列了. 也許這樣說你不一定明白. 舉一個例子, 假如有一個dna, 互補(bǔ)序列是gatccgat, 我們試著做一下: 在第一個反應(yīng)中由于含有dntp+ddatp, 所以遇到g, t, c三個堿基時沒什么問題, 但遇到a時, 摻入的可能是datp或ddatp, 比如已合成到g, 下一個如果參與反應(yīng)的是ddatp則終止, 產(chǎn)生一個僅有2個核苷酸的序列: ga, 否則繼續(xù)延伸, 可以產(chǎn)生序列g(shù)atccg, 又到了下一個a了. 同樣有兩種情況, 如果是ddatp摻入, 則產(chǎn)生的序列是gatccga, 延伸終止, 否則可以繼續(xù)延伸, 產(chǎn)生gatccgat. 所以在第一個反應(yīng)系統(tǒng)中產(chǎn)生的都是以a結(jié)尾的片段: ga, gatccga, 同理在第二個反應(yīng)中產(chǎn)生的都是以c結(jié)尾的片段: gatc, gatcc, 在第三個反應(yīng)中產(chǎn)生的都是以g結(jié)尾的片段: g, gatccg 在第四個反應(yīng)中產(chǎn)生的都是以t結(jié)尾的片段: gat, gatccgat, 電泳時按分子量大小排列, a反應(yīng)的片段長度為2, 7; c反應(yīng)的為4, 5; g反應(yīng)的為1, 6; t反應(yīng)的為3, 8, 四個反應(yīng)的產(chǎn)物分別電泳, 結(jié)果為 8 7 6 5 4 3 2 1 a | | c | | g | | t | | 我們可以從右向左讀, 為gatccgat, 至此, 測序完成(上面這個圖在百度知道中顯示不正常, 因為百度知道的網(wǎng)頁用的是比例字體, 你如果想看它, 拷貝到記事本中, 用等寬的字體來看).
主要的是雙脫氧測序,是最經(jīng)典的現(xiàn)在測序方法已發(fā)展到第三代,可實現(xiàn)高通量測序
文章TAG:測序技術(shù)測序技術(shù)蛋白

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