所以運行qPCR后,除了Ct值,其他數據在后續的分析計算中幾乎沒有用,模板的Ct值與模板的初始拷貝數的對數有一定的線性關系,勇往直前數據分析,首先對數據進行規劃,擬定數據來源和采集工具;然后通過采集平臺對數據進行采集和處理,可以生成明確的報表或者錄入數據庫,數據分析流程使用數據分析工具連接到數據進行數據探索。
qPCR的數據處理方法是△△Ct法,其特點是僅依靠Ct值計算結果。所以運行qPCR后,除了Ct值,其他數據在后續的分析計算中幾乎沒有用。但前提是目標基因和內參基因的擴增效率要基本相同。1.我們先來了解一下什么是Ct值?Thresholdcycle也寫作Cq值,熒光信號達到熒光閾值時的PCR循環次數。儀器軟件通常將第3-15個周期的熒光值設置為基線。閾值通常是基線標準偏差的10倍。模板的Ct值與模板的初始拷貝數的對數有一定的線性關系。模板的初始濃度越高,Ct值越小。初始模板劑量濃度越低,Ct值越大。當PCR的循環達到Ct值的循環數時,才剛剛進入真正的指數擴增期(對數期)。此時輕微的誤差還沒有被放大,Ct值的重現性較好,即相同含量的初始值為模板,得到的Ct值比較穩定。
勇往直前數據分析,首先對數據進行規劃,擬定數據來源和采集工具;然后通過采集平臺對數據進行采集和處理,可以生成明確的報表或者錄入數據庫。數據分析流程使用數據分析工具連接到數據進行數據探索。這里可以使用excel或者一些BI工具。目前國內有很多自主研發的BI工具非常好用,比如我們公司正在使用的DataFocus,非常方便;最后把需求和市場結合起來,生成一個完整的數據分析 report文檔,也可以利用DataFocus的廣告牌,直接整合成一個漂亮的大屏,直接向領導或客戶演示。
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